不过为了躲避以色列政府的暗杀阿拉法特总是居无定所，就连行踪都十分的神秘，像是乘坐的交通工具很多都是临时租借的，让以色列政府来不及反应，阿拉法特便消失在视野当中。在政治斗争和战火的熏陶下，阿拉法特已经培养出了高度的惊觉，让他总是能在危险到来之前察觉到，而他凭借着这份”嗅觉”多次拯救了自己以及同伴的生命。

像是1969年初的第一次暗杀，以色列派出了安插在巴勒斯坦中的内奸，悄悄地埋伏阿拉法特的专车旁，并将窃听器与雷达发射器安装在阿拉法特专车的车底，企图为以色列轰炸机指引目标，不过这点小伎俩很快就被曾经身为工程师的阿拉法特发现并拆除了。这次任务的失败令以色列十分的不服气同年再次行动暗杀阿拉法特。

既然不能在车上下手，那么就从包裹下手，同年，阿拉法特在游击队的营地内，收到了一个没有任何信息的包裹，面对这样的包裹阿拉法特充满了怀疑，便让卫兵先将这份包裹放在办公室外，谁知道当那名卫兵将包裹刚放下，包裹便瞬间炸成了粉碎。阿拉法的运气让以色列政府很不服气总是找机会对他进行暗杀。

不过这样一位对危险充满着警觉的阿拉法特竟然连一场疾病都抗不过去，2004年11月，阿拉法特于法国巴黎病逝。虽然官方表示阿拉法特是因为生病而逝世，但真实的死因其中必有内幕，在阿拉法特逝世后，他的夫人拒绝了对阿拉法特进行尸检，导致阿拉法特的死因一直都是云里雾里的。

直到2012年的7月，阿拉法特的遗孀在接受记者的采访中表示，在对阿拉法特的遗物进行化验时，发现阿拉法特很有可能是因为核原料剂—210中毒而死，不仅是在他的遗物中，在他病服上的血斑中也发现了高于致死量20倍的血。这样的发现让巴勒斯坦的民众将目光放在了以色列身上，不仅因为以色列有着强烈想要阿拉法特死的心，还因为以色列国家内就有着核反应堆，而它就是来自于核反应堆中。