原标题:零基础生信数据挖掘-老司机带你搞定Gene signature模型构建
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零基础生信数据挖掘
老司机带你搞定Gene signature模型构建
2021/5/17-18 网络精讲班
概述
1、研究生刚入学没研究思路、没预实验结果?
2、临床医师没时间没平台去实验室?
3、对各类数据处理方法一头浆糊?
赶快来参加莫速乎的零基础生信数据挖掘-老司机带你搞定Gene signature模型构建课程吧!花2天时间,学会利用R语言分析各类数据,做出漂亮的图片。
课程目标
1、使学员了解生信类文章的常用套路;
2、熟悉Typora、Graphpad、X-tile、列联表分析工具等软件及TIMER/TISIDB/HPA等网站使用;
3、掌握用R语言实现TCGA/GEO数据下载及清洗,差异基因筛选,可视化三线表绘制,Kaplan-Merier/ROC曲线绘制,列线图模型构建与验证,GSEA分析,GO/KEGG分析等。
在此基础上,学员可以轻松进阶肿瘤免疫浸润/X信号通路相关基因标签模型构建、非肿瘤类生信分析等。
课程特色
1、源头解析:深入剖析生信类文章的思路,讲解每种分析方法的作用及意义。
2、触类旁通:讲解每种分析方法如何用R代码实现,在非肿瘤专业的生信分析中同样适用。
3、资源彩蛋:各种好用的科研小软件、SCI组图技巧大放送。
4、经典再现:从思路构建,到数据处理,再到作图组图,现场完成一篇文章。
图片展示



课程设置
| 日期 | 时间 | 授课内容 |
| Day 1 | 08:30-11:30 | 科研资源-先利其器1、 Typora 、R 、Graphpad 、SPSS 、X-tile 、列联表分析工具、下载工具等软件介绍2 、GeneCards 、TCGA 、GEO 、生信技能树、R Graph Gallery 、TIMER/TISIDB/HPA 、STRING 等网站介绍 |
| 13:30-15:30 | 文献阅读-上兵伐谋1、 归纳总结生信类文章的基本套路2、 解读统计方法及图片意义 | |
| 15:30-17:00 | 代码实现-逐个击破1 、R 基本语法2 、TCGA/GEO 数据下载及清洗 | |
| 18:30-20:30 | 彩蛋1 、WGCNANMFGSVA 方法介绍2 、SCI 图片格式要求3 、Illustrator 组图 | |
| Day 2 | 08:30-11:30 | 代码实现-逐个击破1 、差异基因分析(Volcano & Heatmap )2 、Gene signature 模型构建(Cox & Lasso )3 、临床病理相关性(可视化三线表、小提琴图、相关性图)4 、生存分析(K-M 曲线、ROC 曲线、单/ 多因素Cox ) |
| 13:30-15:30 | 代码实现-逐个击破1 、Nomogram, Calbration curve & DCA curve 2 、GSEA 3 、PPI, GO & KEGG | |
| 15:30-17:00 | 现学现卖完成一篇生信文(思路– 数据– 图片) |
会务信息
2021/5/17-18
使用腾讯会议客户端进行在线讲课(非录播)
注册费用
3200元/人
两天集中网络授课,互动性好;
可开具会务费、数据分析费、测序费、检测费等发票;
课后赠送课堂同步视频,可无限重复回放;
参加培训的学员可通过微信群继续和老师交流,长期获得答疑机会;
如果本次没学会,以后还可免费参加本班(疫情过后可免费参加线下培训)。
报名咨询
缴费账号
方法一:企业银行转账
收款单位:上海荆麦信息科技中心
开户行:中国建设银行上海泗泾支行
银行账号:3100 1983 0100 5002 2781(转账去空格)
备注:写明姓名+模型构建 以便于核实
方法二:支付宝转账
支付宝收款账户:[email protected]
请核对户名:上海莫速乎教育投资有限公司
备注:写明姓名+ 模型构建以便于核实
方法三:信用卡或公务卡支付
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付款备注:写明姓名+ 模型构建,便于核实
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如有多人参加,逐个说明即可。
其他培训
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| 5月21-23日 |
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